Polimorfizm związany z cholesterolem i ryzykiem zdarzeń sercowo-naczyniowych czesc 4

Skumulowane krzywe zapadalności skonstruowano zgodnie z wynikiem genotypu za pomocą analizy regresji Coxa. Aby ocenić zdolność oceny genotypu w celu klasyfikacji ryzyka, opracowaliśmy wykresy charakterystyk działania odbiornika (ROC) dla 14 podstawowych współzmiennych z oceną genotypu lub bez. 20 Jako wynik wykorzystano częstość zdarzeń sercowo-naczyniowych po 10 latach. Statystyka C, miara powierzchni pod krzywą ROC, została obliczona z wynikiem oceny genotypu i bez niego. Oceniliśmy również zdolność wyniku genotypu do przeklasyfikowania ryzyka w kategoriach zarysowanych przez Panel III dla Dorosłych Leczenia Narodowego Programu Edukacji Cholesterolowej21 za pomocą dwóch oddzielnych podejść sugerowanych przez Cook22 i Pencina i wsp.23.
Wszystkie analizy asocjacji genetycznej przeprowadzono przy użyciu oprogramowania SPSS, wersja 14.0. Testy dla założenia zagrożeń proporcjonalnych przeprowadzono za pomocą pakietu przeżycia dla R; Krzywe ROC i statystyki C zostały wygenerowane przy użyciu pakietu ROCR dla R (www.r-project.org).
Wyniki
Charakterystyki poziomu bazowego
Spośród 6103 osób z MDCS-CC, 563 nie dostarczyło wyjściowej próbki osocza, 56 nie posiadało danych dotyczących poziomów cholesterolu LDL lub HDL, 18 nie posiadało DNA, a 52 nie miało genotypów dla co najmniej jednego SNP. 24 Pozostało 5414 osób, które kwalifikowały się do obecnego dochodzenia.
Tabela 1. Tabela 1. Podstawowe cechy osobników. Wyjściową charakterystykę osobników przedstawiono w Tabeli 1. Wszystkie badane osoby były pochodzenia europejskiego. Średni wiek (. SD) wynosił 58 . 6 lat, a 59% stanowiły kobiety. Niewielki odsetek pacjentów otrzymywał terapię zmniejszającą stężenie lipidów (2,3%) lub przeważał zawał mięśnia sercowego lub udar (2,3%).
Związki SNP-Lipid i wynik genotypu
Tabela 2. Tabela 2. Związek pomiędzy polimorfizmami pojedynczego nukleotydu (SNP) i lipoproteinami o niskiej gęstości (LDL) lub lipoproteinami o dużej gęstości (HDL). W celu walidacji związku między SNP a poziomem lipidów dostępnych było 5287 osób, które nie otrzymywały leczenia hipolipemizującego na początku badania. Potwierdziliśmy związek pomiędzy każdym z 11 SNP z poziomami cholesterolu LDL lub cholesterolu HDL (Tabela 2). Proporcja wariancji resztkowej wyjaśniona przez każdy SNP była niewielka, w zakresie od 0,1 do 2,5%. Wśród SNP, które były związane z poziomami cholesterolu LDL, różnica w poziomie cholesterolu LDL między klasami homozygot wynosiła od 3 mg do 72 mg na decylitr (od 0,1 do 1,9 mmol na litr). Wśród SNP związanych z cholesterolem HDL różnica wahała się od 3 mg do 5 mg na decylitr.
W przypadku loci APOB i LDLR w każdym locus były dwa znaczące skorelowane SNP. Wybraliśmy SNP z silniejszym dowodem na powiązanie w każdym locus (odpowiednio rs693 i rs1529729) w celu włączenia do wyniku genotypu. Zatem analizy dotyczące genotypów z prognozowaniem zdarzeń sercowo-naczyniowych składały się z dziewięciu SNP z dziewięciu loci (Tabela 2).
Następnie skonstruowaliśmy wynik genotypu dla każdego osobnika, licząc liczbę niekorzystnych alleli przenoszonych przez ten osobnik dla każdego SNP.
[podobne: medyk szopena rzeszów, magmil bio special, orsalit plus smektyn ]

Powiązane tematy z artykułem: magmil bio special medyk szopena rzeszów orsalit plus smektyn